SSHクライアントはPuTTYの派生版『D2D/DW PuTTY』をずっと使わせてもらっています。
見た目がクールでいいですよね。
ウィンドウを透過設定できるところが個人的に好みです。

導入方法は、まずGDI PuTTYというGDI版のPuTTY(同じ作者さまです)をインストール後、D2D/DW PuTTYをインストールフォルダに上書きする形になります。
インストールの詳細は、公式サイトで説明されているので参考にしてください。

GDI PuTTY
http://ice.hotmint.com/putty/index.html

D2D/DW PuTTY
http://ice.hotmint.com/putty/d2ddw.html

バージョンアップの際も、同じ要領になります。
ただしバージョンアップの際はputty.iniファイル(と、他のiniファイル)を上書きしないように注意しましょう。
保存した設定が消えてしまいます。